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单细胞免疫组库测序

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2015年,10x Genomics发布了基于微流控和油滴包裹技术的Chromium 单细胞系统平台,可实现高通量的单细胞转录组和单细胞V(D)J测序。不但可以将TCR/BCR双链完美匹配,取得TCR/BCR双链组成情况,而且可以细化到单细胞水平,同时取得5’端转录组信息。

10x Genomics新推出的“单细胞免疫谱分析”利用其微流控芯片制备单细胞体系,选择5'端接头的通用引物和免疫分子恒定区的巢式引物进行V(D)J富集,实现在单细胞水平,对成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)进行全长测序,为免疫组库全面、系统的研究给予了高效的技术平台,对疾病发生、开展的分子机制研究有重要的意义。

 

  样本类型

  动物组织、血液等其他体液、单细胞悬液、细胞系等。

 

  实验流程

10x Genomics单细胞免疫组库实验流程

 

  分析流程

单细胞VDJ免疫组库生信分析流程图

 

  应用方向

  a.抗体的鉴定和新抗体的发现;

  b.揭示Ig库的开展,绘制全局Ig库;

  c.研究传染性疾病,如感染开展中的抗体进化谱系等;

  d.研究免疫失调疾病的V(D)J重组倾向性,寻找免疫失调疾病的生物标记物;

  e.癌症早期检测、癌症进程和复发诊断的标记物以及肿瘤免疫机制的研究。

  

       产品优势

  a.识别和描述罕见细胞类型和生物标志物;

  b.分析组织微环境、疾病进展和药物免疫反应;

  c.对新抗原进行大规模抗体和TCR发现

  d.顺利获得测量免疫细胞表型来描述对感染的免疫反应;

  e.顺利获得大规模单细胞V(D)J+表达谱测序,降低单个细胞成本;

  f.给予流式分选服务,实现免疫细胞目的分选。

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